雖然石墨坩堝擁有體積密度大、耐高溫、傳熱快、耐酸堿侵蝕、高溫強度大、抗氧化性能高等特色，但是對于單個質料的煉制，在坩堝運用以后的整理工作卻很費事。
    石墨坩堝的清洗首要進行的工作是將坩堝內的化學物質整理出來，然后進行清潔，我們需求根據石墨坩堝內的剩余物質是什么來決議用什么東西來清洗，一般石墨坩堝上的附著物是無機焚燒后的殘渣，我們能夠運用鹽酸來進行整理，大多數都是能夠溶解的，一些含有碳成分的殘留物，運用鹽酸是不能溶解的，這時能夠運用硝酸進行清洗，因為硝酸具有強氧化性，在清洗時也能夠適當加熱。
    對于那些仍難以整理的物質，能夠在稀鹽酸或稀硝酸內煮沸，留意所用的鹽酸中不得含有硝酸，硝酸鹽，鹵素比及氧化劑。如果稀硝酸尚不能洗凈時，則用焦硫酸鉀，碳酸鈉或硼砂熔融清洗。
    石墨坩堝需求保持清潔，內外應光亮，經過長久灼燒后，坩堝外表可能黯然無光，日久必深入到內部致使坩堝脆弱決裂，因而有必要清除不清潔的物質。如仍有污點或外表發烏，則用通過100篩意圖無尖銳棱角的細砂，用水潤進行輕輕摩擦，使外表回復光澤。